Az ügynökség kiépítésének célja, hogy a gáz- és villamosenergia-átvitel terén javuljon a határ menti szabályozási együttműködés. Az ügynökség feladata lesz emellett az is, hogy közös szabályokat alakítson ki az európai hálózatokra, valamint tanácsokat is ad majd energiaügyi kérdésekben az uniós intézményeknek. Az új ügynökség kiegészíti és koordinálja a nemzeti szabályozótestületek munkáját.
A székhely elnyerése érdekében Románia, Szlovákia és Szlovénia is komoly kampányt folytatott, az ügynökség a tervek szerint 2011 márciusában kezdheti meg munkáját.