Pálinkás József szerint az MTA Filozófiai Kutatóintézetének igazgatója szerződést kötött az önmaga által tulajdonolt és ügyvezetett céggel kutatások elvégzésére, ez pedig sérti a közalkalmazotti törvény összeférhetetlenségre vonatkozó szabályát.

Az MTA-elnök ugyanakkor elismerte: nem szerencsés a pályázati rendszer sem, hiszen lehetővé teszi, hogy a kutatóintézetek munkatársainak többletmunka címén pluszpénzeket fizessenek ki azért a munkáért, melyet egyébként is folytatnak az intézményben.

Nem szerencsés az sem, hogy laikusok, illetve a sajtó is megfogalmazott olyan véleményt, miszerint ezen kutatások semmit nem érnek, ezt megítélni ugyanis kizárólag a tudomány művelői jogosultak - érvelt Pálinkás, hozzátéve: ily módon bármilyen, a közvélemény számára nem teljesen közérthető tudományos kutatást könnyen nevetségessé lehet tenni.

Pálinkás József a lapnak azt mondta: nem kíván sem Heller Ágnes védőügyvédje, sem Budai Gyula kormánybiztos szárnysegédje lenni, az Akadémia elnökeként van kialakult álláspontja az ügyről, és ez nem esik egybe sem a filozófusokéval, sem különböző sajtótermékekével.