Az állam 2013. januártól az alapítványi és magániskolákban is a központi költségvetésből fizeti az ott dolgozó pedagógusok bérét, ami a költségek 85-90 százalékát teszi ki, míg az eddigi normatív alapfinanszírozás a kiadások felét sem fedezte. A bérfinanszírozáson túl, a jövőben is több lehetőség áll az alapítványi és magániskolák rendelkezésére, hogy a hiányzó összeget pályázati úton, vagy a helyi önkormányzatokkal kötött megállapodások révén előteremtsék.

Az Emberi Erőforrások Minisztériuma és az Oktatásért Felelős Államtitkárság kiemelt figyelmet fordít az iskolákat fenntartó kisegyházak intézményeire is. Szeptembertől a közfeladatokat átvállaló, hátrányos helyzetű gyermekek nevelését ellátó fenntartókkal olyan egyedi szerződéseket köt, mely biztosítja, hogy munkájukat megnyugtató körülmények között folytathassák.

Alaptalanok azok a hírek, melyek arról szólnak, hogy az alapítványi és magániskolák, valamint a kisegyházak intézményei kiszolgáltatott, létükben elbizonytalanított helyzetbe kerülnek. Ellenkezőleg, átlátható, egyértelműen szabályozott és társadalmi hasznosságával arányos finanszírozású rendszer jön létre.